矿石进口许可证（特别是自动进口许可证）的办理程序可以分为以下几个步骤：

　　一、准备申请材料：

　　进口商需要准备一系列相关的申请材料。这些材料包括但不限于：公司资质证明（如营业执照、进出口经营权证明等）、进口合同、矿石的规格和数量说明、收货人从事货物进口的资质证书（如果是初次申领）、以及可能需要的委托代理进口协议（如果是通过代理进口）。

　　二、提交申请：

　　进口商将准备好的申请材料提交给商务部或其授权的机构。这一步通常需要在商务部或其授权机构的官方网站上在线填写并提交《自动进口许可证申请表》，或者将纸质材料递交至相关部门。

　　三、审查和处理：

　　商务部或其授权的机构会对申请材料进行详细审查。审查过程中，可能会要求进口商补充材料或更正信息。如果申请材料齐全且符合要求，商务部或授权机构会受理申请，并进行后续的审批流程。

　　四、领取进口许可证：

　　一旦申请被批准，进口商可以在指定的时间从商务部或其授权机构领取矿石进口许可证。许可证通常会注明有效期、矿石的种类、数量和规格等信息。

　　五、使用进口许可证：

　　进口商在进口矿石时，需向海关出示有效的进口许可证。海关会核对许可证信息与实际进口货物是否一致，以确保合规性。

　　请注意，具体的申请流程和所需材料可能因矿石种类、进口量以及国家政策的变化而有所不同。因此，在实际操作前，建议进口商向商务部或其授权机构咨询最新的申请指南和要求。

　　此外，虽然流程中未明确提及费用，但在办理过程中可能需要缴纳一定的申请费用或行政费用，具体金额和支付方式也需向相关部门咨询确认。